En la segunda mitad de la década de los 60 aparecen en España los primeros investigadores y especialistas que, desde la Universidad o centros de estudios públicos o privados, elaboraban los primeros libros y trabajos de análisis económico o social con perspectiva regional. Sin embargo, hasta los años 70 a penas existen foros o grupos de trabajo en torno a la Ciencia Regional, en parte por el evidente rechazo que este enfoque regional provocaba en el régimen franquista y, en parte, por lo incipiente que era la disciplina en todo el mundo.
En diciembre de 1973, bajo el patrocinio del Servicio de Estudios del Banco Urquijo en Barcelona, se celebró una reunión general de Servicios de Estudios que, tanto por la temática como por el acuerdo de los asistentes, se transformó en la I Reunión de Estudios Regionales al mismo tiempo que se decidió crear la Asociación Española de Ciencia Regional (AECR). Esta I Reunión tuvo su continuación en la II Reunión de Estudios Regionales que se celebró en Canarias entre el 2 y el 6 de mayo de 1975, donde se aprobó un primer documento sobre la “Problemática Regional en España”.
No obstante, la AECR no fue legal hasta el 19 de abril de 1976, tras superar una serie de dificultades político-administrativas. La primera asamblea general de la Asociación se celebró en Oviedo en el transcurso de la III Reunión de Estudios Regionales, siendo inicialmente 164 el número total de asociados. Desde entonces la AECR fue experimentando un continuo crecimiento hasta convertirse en la década de los 80 en la asociación de referencia en España sobre temas de Ciencia Regional. La AECR se integro en la red de asociaciones internacionales de Ciencia Regional (RSAI) y en la red europea de asociaciones de Ciencia Regional (ERSA) consolidándose plenamente como una asociación científica que integra a los investigadores y profesionales de la Ciencia Regional en España y los conecta internacionalmente en redes y asociaciones equivalentes de Europa y resto del mundo.
En el siglo XXI el papel de la AECR como dinamizadora de la Ciencia Regional con proyección internacional, interestatal científico y sin animo de lucro se consolida plenamente. Los congresos que se celebran desde inicio del presiente siglo reúnen a la mayor parte de investigadores españoles. La AECR edita la revista Investigaciones Regionales, cuyo prestigio ha ido consolidándose y acrecentándose desde su fundación. Ahora la AECR ofrece servicios de apoyo a jóvenes investigadores en Ciencia Regional, conecta a los investigadores españoles con los del resto del mundo y ejerce un papel de creciente importancia en Europa y América Latina.